La baignade dans la Loire est strictement interdite depuis 1969, en raison de sa dangerosité et de courants instables :
Sur ses berges, l’existence de « sables mous », se dérobant sous les pieds des marcheurs, et les effondrements de « culs de grèves », escarpements de sable également très fragiles, nécessite une attention accrue.
Dans l’eau, les nombreux ouvrages d’arts, barrages et écluses présents tout au long du fleuve participent à créer un courant changeant, d’apparence calme mais souvent tumultueux.
De plus, le site de l’ARS Pays de la Loire pointe du doigt des eaux dangereuses au niveau sanitaire, comportant des risques infectieux. La présence de cyanobactéries est notamment pointée du doigt. Certains animaux sauvages peuvent également amener avec eux des maladies, transmissibles via l’eau, comme la leptospirose.
Enfin, les échouages d’algues vertes sur certaines côtes du fleuve, produisant des gaz toxiques nocifs, n’incitent pas à la baignade.